A Unidade de Controle Interno da UERN (UCI/UERN) é um órgão de natureza instrumental, parte do Sistema Integrado de Controle Interno do Poder Executivo, que é o conjunto de órgãos, funções e atividades previstas na Lei Complementar n° 638/2018-RN, sendo composto pela Controladoria-Geral do Estado (CONTROL), como Órgão Central, e pelas Unidades de Controle Interno (UCI), de caráter permanente, e abrange toda a Administração Pública Direta e Indireta do Estado do Rio Grande do Norte.
A Unidade de Controle Interno da UERN foi instalada oficialmente no ano de 2006, com a responsabilidade de realizar a fiscalização contábil, financeira, orçamentária, operacional e patrimonial no âmbito da universidade, bem como avaliar os resultados obtidos pela administração.
